Taikinan valmistus aloitetaan yleensä edellisenä iltana. Ruisjauhot, vesi, suola ja juuri sekoitetaan, ja taikinaa jätetään tekeytymään huoneenlämpöön. Pitkä kohoaminen tekee taikinasta helposti käsiteltävää ja antaa leivälle syvän makusävyn. Näkkileipätaikina on perinteisesti melko kiinteää, jotta siitä voi kaulita ohuita, pyöreitä levyjä. Monissa perinteissä leivän keskelle tehdään reikä, jonka ansiosta näkkileipiä voidaan säilyttää pujottamalla ne varraspuuhun.